科罗拉多大学药学院起源于1911年，最初是博尔德分校医学院的一个分支。1913年开始成为一个独立的院系，1957年成为一所学院。1938至1939年获得药学教育认证委员会（Accreditation Council for Pharmacy Education，简称ACPE）认证开始授予药剂学士学位，1995至1996年获得全面认证，开始授予药学博士学位。1986年，药学院行政划转至丹佛的科罗拉多大学健康科学中心，1992年8月至11月，所有教职员工和学生都已从博尔德分校转移到这里。2008年，学院迁至安舒兹医疗校区，并提供药学、分子毒理学、医药学和医药成果研究的医疗和研究生学历，这里30%的学生来自其他的州。2009年，美国国家卫生研究院对药学院和药理部门分别授予了731万389美元和1918万9543美元的奖励。2011年，药学院又一次迁至新大楼，斯卡格斯药学和医药学学院也将入驻安舒兹医学校区。